Gli Studi Archeologici qualificano i progetti ferroviari sulla base di parametri specifici: acquisizione dei dati d'archivio e bibliografici derivanti dall'analisi della cartografia storica, dalla toponomastica, dalla aerofotointerpretazione e da campagne di ricognizione di superficie per l'osservazione dei terreni.
Inoltre, consentono di elaborare la mappatura dei ritrovamenti archeologici attestati nell'ambito territoriale degli interventi, con indicatori di rischio potenziale, correlati alla entità delle preesistenze antiche note ed alle caratteristiche delle opere in progetto.

Sulla base delle risultanze degli Studi Archeologici, in accordo con le Soprintendenze Archeologiche, Italferr redige progetti calibrati per l'esecuzione di indagini geofisiche, carotaggi geoarcheologici, saggi e trincee esplorative, scavi in estensione.
A seguito della fase progettuale, esegue le attività di campo condotte sotto la supervisione e la direzione tecnico-scientifica delle Soprintendenze Archeologiche territorialmente competenti, curandone la Direzione Lavori e il coordinamento relativo alla sicurezza sui cantieri.

Italferr cura ogni aspetto connesso all'esecuzione dell'indagine archeologica, quale l'accesso alle aree oggetto della verifica, la bonifica da ordigni esplosivi, l'allestimento dei cantieri.
Le attività di campo sono eseguite da società e ditte archeologiche mediante l'impiego di mezzi meccanici e l'ausilio di manodopera specializzata rappresentata da archeologi, topografi, disegnatori, antropologi, geologi e restauratori. Una volta concluse tale attività, viene eseguita la verifica della documentazione tecnico-scientifica relativa agli esiti delle indagini effettuate che diventa parte integrante del progetto ferroviario sin dalle prime fasi e rappresenta lo strumento per ottenere i necessari nulla osta prima dell'avvio della fase di realizzazione.
Questo nuovo approccio ha permesso ad Italferr di conseguire risultati significativi, quali la programmazione controllata dei tempi e dei costi di esecuzione delle indagini archeologiche e la drastica riduzione dei rinvenimenti in corso d'opera.

Italferr, di concerto con le Soprintendenze Archeologiche, cura le attività connesse al post-scavo e alla valorizzazione dei contesti archeologici più significativi, mediante studio, catalogazione e restauro dei reperti, elaborazione di banche-dati e piattaforme GIS, pubblicazioni scientifiche, progettazione e allestimento di spazi museali.
Inoltre la vasta esperienza maturata nel campo dell'Alta Velocità ha permesso di sperimentare un approccio innovativo e ha evidenziato la necessità di applicare nuove metodologie per rendere l'archeologia un "elemento progettuale". L'opera ferroviaria diventa così un'occasione per conoscere e valorizzare il consistente patrimonio archeologico delle aree attraversate.